因为相信云上有天国存在的大雄，去图书馆找资料（全都是神话故事），后来想离家出走，去找天国，哆啦A梦担心他，和大雄在云上建造一个自己理想中的国家，并且在朋友们的协助下完成了王国。但是，某天在气流的影响下，撞到高山，发现了一个男孩（达加罗）在一只有耳的巨型乌龟（后来得知是绝迹的雕嘴兽）的背上，最后却意外发现真的有天上人居住的天上世界。天上世界的保护区保有了许多地上的已绝种动物。天上人因为担心地上世界的人类再继续这样污染环境，地球迟早会灭亡，所以计划实施「把地上世界的动植物和人类送到天上世界避难，再以大洪水将地上文明全部毁灭」的恐怖策略──「诺亚计划」……。