以西元2036年作为背景，东京因为核电厂发生爆炸，全市受到严重辐射污染而遭到封锁。而此时有三名高中女生冒险深入这座死城，这些女孩是以基因改造技术所生产、体内有辐射抗体的孩子，目前隶属于陆上自卫队第三师特种部队的她们代号是《柯佩莉亚娃娃》，任务是救出生存者们…