在扶桑国佐世保航空预备学校上学的学生雁渊光。为了能稍微赶上精英魔女兼佐世保的英雄，姐姐·雁渊孝美，每天不断努力的魔法少女今天也独自在山路上奔跑。 在那样的一天，父亲负责的无线发信处收到了一份报告。“于今天下午，第三航空战队入港”。“三航战…是姐姐！”欣喜的光坐立不安，赶着跑去那个地方。