“除妖”，是指将出于各种缘由离开原本所在的“隐世”、在“现世”逗留的妖怪们送回“隐世”的工作。某一天，被妖怪附身的高中男生芦屋花绘偶然看到了除妖师的广告，为了提出委托而前往“怪物庵”。在那里，他遇到了一脸不愉快的“怪物庵”主人??安倍晴斋。结果由于某种原因，芦屋就这样开始在物怪庵打起了工……