就读于培训用以取缔残存魔力威胁的“异端审问官”专业机关——“对魔导学园”的男主角草薙哮，是个完全不会使用枪械，只靠一柄刀与敌人交锋的另类。而他率领的第35试验小队又被称为“杂鱼小队”。当拥有魔女猎人资格的超精英高手凤樱花加入了这支队伍，一场学园动作奇幻大作就此开始。